Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Sap130-202ENSMUST00000178164 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm37484-201ENSMUST00000195378 2523 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm16033-201ENSMUST00000144915 596 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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