Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Gm8446-201ENSMUST00000188834 2712 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Rrh-202ENSMUST00000171313 1759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Cipc-205ENSMUST00000187814 4098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Cipc-201ENSMUST00000038369 4098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Xrcc5-201ENSMUST00000027379 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krt23Q99PS0 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Krt23Q99PS0 Mepe-201ENSMUST00000066207 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Krt23Q99PS0 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Krt23Q99PS0 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Krt23Q99PS0 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Krt23Q99PS0 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Krt23Q99PS0 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt23Q99PS0 BC017643-202ENSMUST00000106115 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt23Q99PS0 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt23Q99PS0 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt23Q99PS0 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt23Q99PS0 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt23Q99PS0 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt23Q99PS0 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms