Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Fbxw11-202ENSMUST00000093205 3938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 D030018L15Rik-203ENSMUST00000140253 2902 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Ank3-206ENSMUST00000092434 5886 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Inpp4a-207ENSMUST00000136846 3576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Six6-201ENSMUST00000021519 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Cald1-203ENSMUST00000115021 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Atg16l1Q8C0J2 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Atg16l1Q8C0J2 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Atg16l1Q8C0J2 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Atg16l1Q8C0J2 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Boc-201ENSMUST00000114634 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Cspp1-201ENSMUST00000071087 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap45-203ENSMUST00000105373 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Stxbp5l-203ENSMUST00000114780 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Pik3c3-203ENSMUST00000115812 3257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Olfm4-203ENSMUST00000228749 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Pibf1-201ENSMUST00000022650 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Atg16l1Q8C0J2 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Mkl1-203ENSMUST00000131235 4222 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gcm1-201ENSMUST00000024104 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 AU040320-203ENSMUST00000102608 4073 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Rbm19-201ENSMUST00000031590 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 AC104200.1-201ENSMUST00000224527 1746 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Rfx2-201ENSMUST00000002444 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo34-204ENSMUST00000165714 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Stxbp5l-206ENSMUST00000114787 4394 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg16l1Q8C0J2 Sv2b-201ENSMUST00000085164 5307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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