Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Nod2-203ENSMUST00000118370 4653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Dsg1bQ7TSF1 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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