Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Arhgap6-205ENSMUST00000112131 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Xdh-201ENSMUST00000024866 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Cdk20-201ENSMUST00000021939 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Btg1-201ENSMUST00000038377 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Sv2b-201ENSMUST00000085164 5307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm26903-201ENSMUST00000180749 4583 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Mpp2-201ENSMUST00000017458 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms