Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 AC166165.1-201ENSMUST00000214352 874 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Sdhaf3-201ENSMUST00000040826 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Serpina3m-201ENSMUST00000101078 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ins2-202ENSMUST00000105930 583 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Serpina3m-202ENSMUST00000168797 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Cpm-201ENSMUST00000020399 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Csnk2a1-201ENSMUST00000099224 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm27203-201ENSMUST00000183677 307 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms