Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ces1a-201ENSMUST00000095211 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm45330-201ENSMUST00000209681 1575 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gabrr3-201ENSMUST00000114341 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm36948-201ENSMUST00000194708 3247 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm42735-201ENSMUST00000201718 1646 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm14654-201ENSMUST00000118620 447 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Rps29P62274 AC157931.1-201ENSMUST00000198565 346 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms