Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 AI463170-201ENSMUST00000217839 970 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 Strip2-202ENSMUST00000115224 3524 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Ccna1-201ENSMUST00000029368 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Catsperd-201ENSMUST00000112979 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Inpp4b-212ENSMUST00000215332 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Serpinb9c-201ENSMUST00000021837 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Cldn12-207ENSMUST00000179804 3752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 Gm20658-202ENSMUST00000177059 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm20735-201ENSMUST00000212077 1979 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Wdr35-201ENSMUST00000085745 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 Gm25953-201ENSMUST00000175338 83 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
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