Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC112259.1-201ENSMUST00000222891 853 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm18500-201ENSMUST00000223493 820 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Rnase11-201ENSMUST00000076106 713 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 2310034C09Rik-201ENSMUST00000089111 946 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Kcnip4-206ENSMUST00000175660 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Plekha5-206ENSMUST00000203774 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Trim13-202ENSMUST00000165015 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm33940-201ENSMUST00000209205 1601 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Xlr4b-202ENSMUST00000069103 1304 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Col5a3Q9JLI2 4930528P14Rik-201ENSMUST00000152815 509 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm26739-201ENSMUST00000181041 427 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 2900076A07Rik-207ENSMUST00000181492 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Col5a3Q9JLI2 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm38320-201ENSMUST00000192767 1281 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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Col5a3Q9JLI2 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Col5a3Q9JLI2 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 AC121997.1-201ENSMUST00000226423 793 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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Col5a3Q9JLI2 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Col5a3Q9JLI2 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 D330041H03Rik-207ENSMUST00000181760 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Col5a3Q9JLI2 Apol7a-204ENSMUST00000176074 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Col5a3Q9JLI2 AC126939.2-201ENSMUST00000225989 307 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 AC107369.2-201ENSMUST00000226154 916 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Tpmt-201ENSMUST00000021806 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Map2k7-204ENSMUST00000110995 1558 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Col5a3Q9JLI2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Cntln-203ENSMUST00000107190 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm43255-201ENSMUST00000198885 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Snx6-204ENSMUST00000218934 1441 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Nsg2-202ENSMUST00000093219 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm12014-201ENSMUST00000120164 1620 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm6341-201ENSMUST00000119683 411 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm5389-201ENSMUST00000120893 1176 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm11520-201ENSMUST00000122837 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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