Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Celf4-202ENSMUST00000115816 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Inpp5k-201ENSMUST00000006286 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ccnt1-201ENSMUST00000012104 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Wnk4-201ENSMUST00000103108 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm35288-201ENSMUST00000216565 2731 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Pard3b-201ENSMUST00000046673 3426 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ccdc97Q9DBT3 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ccdc97Q9DBT3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ccdc97Q9DBT3 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms