Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms