Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Mmrn2-201ENSMUST00000111908 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Rnf121-201ENSMUST00000089052 2344 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Itgb6-201ENSMUST00000028348 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm20658-202ENSMUST00000177059 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 AC157476.2-201ENSMUST00000217574 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Ptpn20-201ENSMUST00000022508 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Usp10-202ENSMUST00000108988 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Nfam1-202ENSMUST00000100377 2881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Sh3tc1-207ENSMUST00000201511 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 5430430B14Rik-201ENSMUST00000209427 1630 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Sepsecs-201ENSMUST00000031069 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Pik3c3-203ENSMUST00000115812 3257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms