Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Fanci-202ENSMUST00000118959 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Rab3b-201ENSMUST00000003502 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Arhgap45-203ENSMUST00000105373 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Cul4b-201ENSMUST00000016681 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 AC140299.1-201ENSMUST00000217855 1510 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm5776-201ENSMUST00000122119 321 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm16585-201ENSMUST00000161442 610 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm22649-201ENSMUST00000175134 298 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm29323-201ENSMUST00000189792 332 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Ly6g5b-201ENSMUST00000062657 1046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 BC030343-201ENSMUST00000199606 2439 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Cabyr-202ENSMUST00000115857 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Hbq1b-201ENSMUST00000101387 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Cuta-202ENSMUST00000114935 597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm15516-201ENSMUST00000117292 193 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm13685-201ENSMUST00000122462 141 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 1700031F10Rik-202ENSMUST00000156018 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Coq8a-208ENSMUST00000160879 561 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 2900076A07Rik-201ENSMUST00000180385 914 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 2900076A07Rik-207ENSMUST00000181492 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Mark4-ps-201ENSMUST00000196140 384 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm32591-201ENSMUST00000203038 414 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 2810455O05Rik-201ENSMUST00000138442 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Prpf39-201ENSMUST00000120580 4069 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm20735-201ENSMUST00000212077 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Snca-202ENSMUST00000163779 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm3752-202ENSMUST00000167833 450 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm10128-201ENSMUST00000171360 615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm25736-201ENSMUST00000175165 101 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm2956-202ENSMUST00000178722 450 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm10340-202ENSMUST00000188235 615 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Olfr925-ps1-201ENSMUST00000217295 780 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 1700017D01Rik-201ENSMUST00000025635 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Lyg1-201ENSMUST00000027254 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gm23973-201ENSMUST00000083320 321 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Slc25a14-204ENSMUST00000134257 1805 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TrioQ0KL02 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms