Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Slco4c1-201ENSMUST00000071985 4908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Ppip5k1-203ENSMUST00000110626 5171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Polq-201ENSMUST00000054034 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Vps8-204ENSMUST00000117598 4935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Wdr35-201ENSMUST00000085745 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Aoc3-202ENSMUST00000103105 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Ube2f-203ENSMUST00000171165 5654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm12035-201ENSMUST00000121890 623 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Mkl1-203ENSMUST00000131235 4222 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PrcdQ00LT2 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms