Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Zfp131-203ENSMUST00000223722 3109 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm18616-201ENSMUST00000222898 1400 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Exosc1-201ENSMUST00000075280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Prune2-202ENSMUST00000223920 1803 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm45193-201ENSMUST00000204686 1552 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm12700-201ENSMUST00000118145 457 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm5054-201ENSMUST00000119351 453 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 2310026L22Rik-201ENSMUST00000146658 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm9621-201ENSMUST00000183322 1003 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm7776-201ENSMUST00000191211 720 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Spin3-ps-201ENSMUST00000192825 770 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm44744-201ENSMUST00000208234 852 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm45846-201ENSMUST00000211170 446 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 AL672010.1-201ENSMUST00000215182 1246 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm18745-201ENSMUST00000216018 548 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Pln-205ENSMUST00000219921 531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rps29P62274 AC161763.1-201ENSMUST00000227063 168 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms