Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cd28P31041 2410002F23Rik-202ENSMUST00000071296 4201 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Slc5a4a-201ENSMUST00000020450 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Ctns-201ENSMUST00000006103 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Nedd4l-211ENSMUST00000226058 3393 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm2897-201ENSMUST00000166494 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm3411-201ENSMUST00000170104 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Ccna1-201ENSMUST00000029368 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Xrcc5-201ENSMUST00000027379 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Klf17-201ENSMUST00000062747 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm12035-201ENSMUST00000121890 623 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Kpna6-202ENSMUST00000102590 5710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Sh3kbp1-204ENSMUST00000112451 3914 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm8446-201ENSMUST00000188834 2712 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Arhgap25-203ENSMUST00000113637 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm26903-201ENSMUST00000180749 4583 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Mark1-201ENSMUST00000027929 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 AC104200.1-201ENSMUST00000224527 1746 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm15663-201ENSMUST00000145794 3200 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Wdr6-201ENSMUST00000068700 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Pdk4-201ENSMUST00000019721 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Pfkm-202ENSMUST00000163507 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Rbm19-201ENSMUST00000031590 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cd28P31041 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms