Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Ispd-206ENSMUST00000223068 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm39312-201ENSMUST00000213586 2195 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Sf3a3-201ENSMUST00000030734 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm14174-201ENSMUST00000153158 161 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm25953-201ENSMUST00000175338 83 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm24368-201ENSMUST00000175388 106 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm6225-201ENSMUST00000181558 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm37016-201ENSMUST00000195507 660 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 AC104200.1-201ENSMUST00000224527 1746 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp19Q3UJD6 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 4930480K15Rik-201ENSMUST00000162121 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Poteg-201ENSMUST00000081321 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Pik3r3-202ENSMUST00000106490 1830 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Pla2g5-202ENSMUST00000102511 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms