Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Adamtsl3-203ENSMUST00000173287 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Rnf38-201ENSMUST00000045793 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Cpsf1-201ENSMUST00000071898 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm37484-201ENSMUST00000195378 2523 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 4930429F24Rik-201ENSMUST00000151676 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms