Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Cd74-203ENSMUST00000167610 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Hnrnpc-201ENSMUST00000111610 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Hnrnpc-202ENSMUST00000164655 2843 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm43412-201ENSMUST00000197455 2818 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Tdrd6P61407 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 4930470P17Rik-201ENSMUST00000062355 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm24368-201ENSMUST00000175388 106 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms