Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Hmgb4-201ENSMUST00000053830 746 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Sdhaf3-201ENSMUST00000040826 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Cldn12-207ENSMUST00000179804 3752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 BC017643-202ENSMUST00000106115 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Hinfp-205ENSMUST00000216508 5333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Fhad1-203ENSMUST00000105780 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Cemip-201ENSMUST00000064174 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Adamtsl3-203ENSMUST00000173287 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Gm37484-201ENSMUST00000195378 2523 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pou4f1P17208 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms