Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm16329-201ENSMUST00000148174 371 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Olfr1057-201ENSMUST00000099892 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Atcayos-201ENSMUST00000129834 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm12529-201ENSMUST00000119529 268 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 H2-Pb-201ENSMUST00000172731 531 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Prdx5-204ENSMUST00000173091 501 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm25145-201ENSMUST00000177640 110 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm37218-201ENSMUST00000192917 390 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm38051-201ENSMUST00000193740 433 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm42952-203ENSMUST00000197784 798 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Trav22-201ENSMUST00000198117 346 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm45047-201ENSMUST00000207651 309 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms