Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 AC119177.2-201ENSMUST00000226699 629 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 4930480K15Rik-201ENSMUST00000162121 2199 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Olfr1328-201ENSMUST00000081960 944 ntAPPRIS P2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Olfr73-202ENSMUST00000129056 3048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm8446-201ENSMUST00000188834 2712 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms