Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ScaperF8VQ70 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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