Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tefm-201ENSMUST00000050207 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Tpt1-ps5-201ENSMUST00000112150 516 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 4930479D17Rik-201ENSMUST00000146754 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm20717-201ENSMUST00000176762 657 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm29572-201ENSMUST00000190305 283 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm37012-201ENSMUST00000194991 1078 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm42538-202ENSMUST00000199431 358 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 1700102F20Rik-201ENSMUST00000203859 670 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Il18-204ENSMUST00000214117 860 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ap3m1-201ENSMUST00000022371 1770 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 AC090962.1-201ENSMUST00000226066 1799 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Eda2r-202ENSMUST00000113832 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm33351-202ENSMUST00000215428 1677 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Srsf7-201ENSMUST00000063417 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Eef1g-201ENSMUST00000052248 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ccdc141-203ENSMUST00000111833 631 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Wdr45-202ENSMUST00000115687 1299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm12664-201ENSMUST00000118306 913 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm12962-201ENSMUST00000138697 580 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm16334-201ENSMUST00000159488 694 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Anp32e-207ENSMUST00000170125 413 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Tac1-205ENSMUST00000185187 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 2810429I04Rik-204ENSMUST00000185835 923 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm28922-201ENSMUST00000189785 308 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm29372-201ENSMUST00000191416 364 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm37113-201ENSMUST00000195675 1157 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm15860-203ENSMUST00000197262 360 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm43802-201ENSMUST00000197826 637 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 AC160991.1-201ENSMUST00000224924 753 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 AC139130.1-201ENSMUST00000228281 620 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Sfmbt2-203ENSMUST00000114862 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm18345-201ENSMUST00000200710 1390 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Sav1-201ENSMUST00000021467 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm22900-201ENSMUST00000104538 130 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Mrps18b-202ENSMUST00000113782 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm12452-201ENSMUST00000117128 331 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm14686-201ENSMUST00000119926 343 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm14439-201ENSMUST00000122320 441 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm12257-201ENSMUST00000148244 585 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm8488-201ENSMUST00000176112 1280 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm46142-201ENSMUST00000213332 481 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm46391-201ENSMUST00000220704 203 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Gm15283-202ENSMUST00000221427 818 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 AC154669.1-201ENSMUST00000224405 482 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Olfr1419-201ENSMUST00000087857 1160 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col5a3Q9JLI2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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