Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Mpo-201ENSMUST00000020779 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Siglech-201ENSMUST00000060416 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Sox5-205ENSMUST00000111749 3879 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Sh3tc1-207ENSMUST00000201511 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 5430416N02Rik-201ENSMUST00000180779 3486 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc97Q9DBT3 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms