Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Snap25-201ENSMUST00000028727 2116 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Mageb1-201ENSMUST00000072269 1143 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Mageb1-202ENSMUST00000099471 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Zfp131-203ENSMUST00000223722 3109 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Serpina10-202ENSMUST00000121625 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Brd9-206ENSMUST00000222399 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm11279-201ENSMUST00000121524 1256 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm25953-201ENSMUST00000175338 83 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm8391-201ENSMUST00000185632 726 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm5788-201ENSMUST00000220499 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 AC124173.1-201ENSMUST00000223701 189 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 AC165159.1-201ENSMUST00000223825 631 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm19001-201ENSMUST00000222736 1651 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Mospd1-201ENSMUST00000023836 1763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Isx-201ENSMUST00000034034 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Mospd1-202ENSMUST00000096447 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Etfbkmt-202ENSMUST00000111547 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 n-R5s175-201ENSMUST00000122599 117 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Lyrm7os-201ENSMUST00000154044 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm22762-201ENSMUST00000157395 137 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Atad3aos-204ENSMUST00000174185 482 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm7693-201ENSMUST00000183257 988 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm37622-201ENSMUST00000192162 285 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm36431-202ENSMUST00000209956 687 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm10408-201ENSMUST00000096168 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Ak3l2-ps-201ENSMUST00000120282 672 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm14856-201ENSMUST00000121548 613 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm22609-201ENSMUST00000158286 121 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 4930519F09Rik-201ENSMUST00000159347 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Pou1f1-203ENSMUST00000176038 1174 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 1700084F23Rik-201ENSMUST00000186662 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm18029-201ENSMUST00000219973 844 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 AC159244.2-201ENSMUST00000222051 220 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 AC158519.1-201ENSMUST00000228615 179 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm26397-201ENSMUST00000083703 134 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Serpina5-201ENSMUST00000021495 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm17026-201ENSMUST00000166674 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm17124-201ENSMUST00000168320 1379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 AC151903.1-201ENSMUST00000226677 1423 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Gm14147-202ENSMUST00000178211 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 CT010575.1-201ENSMUST00000220666 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Ccl3-201ENSMUST00000001008 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 Scgb1b30-201ENSMUST00000108083 491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp54Q8BL06 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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