Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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Dsg1bQ7TSF1 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Dsg1bQ7TSF1 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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