Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 AC110091.2-201ENSMUST00000215107 1512 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm14326-203ENSMUST00000108932 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Kcne1-201ENSMUST00000051705 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Nos2-203ENSMUST00000214397 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Pibf1-201ENSMUST00000022650 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm12035-201ENSMUST00000121890 623 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp19Q3UJD6 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms