Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 L1cam-203ENSMUST00000114430 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Diexf-201ENSMUST00000085555 5570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbdsP70122 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbdsP70122 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Dpp4-201ENSMUST00000047812 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Rian-213ENSMUST00000182981 1219 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm7516-201ENSMUST00000186198 706 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 1700012J15Rik-201ENSMUST00000203458 471 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Sfi1-203ENSMUST00000101655 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Elmo1-201ENSMUST00000072519 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm12645-201ENSMUST00000117297 275 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ak3l2-ps-201ENSMUST00000120282 672 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm14174-201ENSMUST00000153158 161 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1229.3 ms