Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm45846-201ENSMUST00000211170 446 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Rab11fip3-201ENSMUST00000118828 3271 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm11800-201ENSMUST00000120050 579 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tdrd6P61407 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms