Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 9630001P10Rik-202ENSMUST00000181335 3006 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Pde1c-204ENSMUST00000164752 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Hgd-203ENSMUST00000160847 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Art4-201ENSMUST00000032341 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Kdm2b-205ENSMUST00000121739 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Atp2a1-201ENSMUST00000032974 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cxcl2-202ENSMUST00000200681 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Lpin1-205ENSMUST00000221297 3100 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Scfd2-208ENSMUST00000151474 3834 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ncald-201ENSMUST00000090150 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Fam110c-201ENSMUST00000041133 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ick-204ENSMUST00000118869 2540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tctex1d1-206ENSMUST00000169211 1000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 AC152922.1-201ENSMUST00000216518 1232 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Lima1-202ENSMUST00000109024 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 BC030343-201ENSMUST00000199606 2439 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Nfam1-202ENSMUST00000100377 2881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Lrit1-201ENSMUST00000120052 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Hivep2-205ENSMUST00000191138 9846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cd22-202ENSMUST00000108125 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm29326-201ENSMUST00000185541 2451 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Prpf40a-208ENSMUST00000210789 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm38148-201ENSMUST00000195166 3012 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms