Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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