Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ak3l2-ps-201ENSMUST00000120282 672 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm12146-201ENSMUST00000127604 518 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm25687-201ENSMUST00000175442 241 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ccdc190-202ENSMUST00000175731 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Car1-203ENSMUST00000181860 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm9621-201ENSMUST00000183322 1003 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm38153-201ENSMUST00000195484 472 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm34664-202ENSMUST00000207661 1032 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Xrcc5-201ENSMUST00000027379 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm32072-201ENSMUST00000200803 1434 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm16287-201ENSMUST00000097827 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Eif2b3-201ENSMUST00000070610 1369 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Myo1h-209ENSMUST00000199567 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Pfn4-201ENSMUST00000020967 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 3300005D01Rik-204ENSMUST00000181484 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 1700083H02Rik-201ENSMUST00000190526 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm37994-201ENSMUST00000192124 409 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm37559-201ENSMUST00000193556 832 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 1700012J15Rik-201ENSMUST00000203458 471 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm38839-201ENSMUST00000203833 633 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 AC154264.2-201ENSMUST00000216569 403 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm3473-201ENSMUST00000216911 1096 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Tcstv3-202ENSMUST00000223967 779 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 AC156561.1-201ENSMUST00000224774 233 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Rpl21-ps12-201ENSMUST00000080061 480 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Lyrm7-205ENSMUST00000144164 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 AC238811.2-201ENSMUST00000224554 1509 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 1700034J05Rik-201ENSMUST00000036592 3007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm13450-201ENSMUST00000121107 167 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm15247-201ENSMUST00000124513 403 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 E130114P18Rik-209ENSMUST00000186369 306 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Col5a3Q9JLI2 Gm29404-201ENSMUST00000187914 397 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm7776-201ENSMUST00000191211 720 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm28313-201ENSMUST00000191411 397 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm35670-201ENSMUST00000192493 397 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm37656-201ENSMUST00000192673 397 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Tpi-rs11-201ENSMUST00000202145 310 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm43903-201ENSMUST00000205126 617 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm38941-201ENSMUST00000208606 529 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Isx-201ENSMUST00000034034 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Sorbs2-228ENSMUST00000153798 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Slc30a2-204ENSMUST00000105874 3153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm33180-201ENSMUST00000217109 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms