Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Foxm1-201ENSMUST00000073316 4652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms