Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Rpusd2Q149F1 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Rpusd2Q149F1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Rpusd2Q149F1 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Rpusd2Q149F1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rpusd2Q149F1 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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