Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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CartptP56388 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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CartptP56388 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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CartptP56388 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CartptP56388 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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CartptP56388 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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CartptP56388 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CartptP56388 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CartptP56388 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CartptP56388 Nod2-203ENSMUST00000118370 4653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CartptP56388 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CartptP56388 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CartptP56388 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CartptP56388 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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CartptP56388 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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CartptP56388 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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CartptP56388 Mir6366-201ENSMUST00000184472 82 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CartptP56388 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CartptP56388 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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