Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 4930480K15Rik-201ENSMUST00000162121 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Ptgs2os2-201ENSMUST00000181308 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm19611-201ENSMUST00000216401 1865 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm8446-201ENSMUST00000188834 2712 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Nt5c1b-203ENSMUST00000143739 1570 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Olfr1328-201ENSMUST00000081960 944 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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H2-Eb1P04230 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Trpc5-201ENSMUST00000040184 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Mepe-201ENSMUST00000066207 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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