Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdfS4R2K0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdfS4R2K0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdfS4R2K0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PdfS4R2K0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdfS4R2K0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdfS4R2K0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdfS4R2K0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdfS4R2K0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PdfS4R2K0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms