Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mbd1Q9Z2E2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms