Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mbd2Q9Z2E1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms