Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn8Q9Z260 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms