Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccne2Q9Z238 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms