Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uso1Q9Z1Z0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uso1Q9Z1Z0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Uso1Q9Z1Z0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Uso1Q9Z1Z0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Uso1Q9Z1Z0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uso1Q9Z1Z0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uso1Q9Z1Z0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms