Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ap3b1Q9Z1T1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ap3b1Q9Z1T1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms