Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lgr5Q9Z1P4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lgr5Q9Z1P4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms