Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms