Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfkbiaQ9Z1E3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NfkbiaQ9Z1E3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfkbiaQ9Z1E3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfkbiaQ9Z1E3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfkbiaQ9Z1E3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfkbiaQ9Z1E3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfkbiaQ9Z1E3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfkbiaQ9Z1E3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NfkbiaQ9Z1E3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfkbiaQ9Z1E3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfkbiaQ9Z1E3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfkbiaQ9Z1E3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfkbiaQ9Z1E3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfkbiaQ9Z1E3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfkbiaQ9Z1E3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfkbiaQ9Z1E3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfkbiaQ9Z1E3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms