Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cpne6Q9Z140 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms