Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skp2Q9Z0Z3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Skp2Q9Z0Z3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp2Q9Z0Z3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms