Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xpr1Q9Z0U0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Xpr1Q9Z0U0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xpr1Q9Z0U0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xpr1Q9Z0U0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xpr1Q9Z0U0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms